Od 1979. Afganistan je u sukobu koji je za posljedicu imao stotine hiljada nestalih i raseljenih osoba. Intervencija Sovjetskog saveza 1979. s ciljem pružanja podrške pro-komunističkom režimu dovela je do desetogodišnjeg rata gerile mudžahedina, koje su podržavale Sjedinjene Američke Države, Saudijska Arabija i Pakistan. Nakon povlačenja Sovjeta, civilni rat se nastavio, a krajem 2001. invazija koju su predvodile Sjedinjene Američke Države srušila je Talibane. Od augusta 2003. NATO-om predvođene Snage za međunarodnu sigurnosnu pomoć  eng. skr. ISAF) izvele su sigurnosne operacije u toku obuke i izgradnje Državnih sigurnosnih snaga Afganistana (eng. skr.ANSF). Afganistan je prvi puta održao svoje demokratske predsjedničke izbore nakon pada Talibana u junu 2014. a planirano je i napuštanje NATO trupa do kraja 2014.godine.

Izvještaj za 2012. godinu koji je pripremila Afganistanska nezavisna komisija za ljudska prava (u daljem tekstu eng.skr. AIHRC) navodi da je preko million ljudi ubijeno, a 1.3 miliona ljudi povrijeđeno ili onesposobljeno u toku 35 godina sukoba. Procjenjeno je da je oko 1 million onih koji su nestali. Ovaj izvještaj AIHRC-a predstavlja dokaz o ni manje ni više od 180 masovnih grobnica i sistematskog masovnog ubijanja od strane Talibana i grupa opozicije.

Afganistanske vlasti nemaju sposobnosti da uspješno pronađu nestale i da identifikuju njihove ostatke. Postoje dokazi da su grobnice uništavane od strane onih koji su htjeli prikriti zločine. U decembru 2008. zabrinut oko prijavljenih iskopavanja na mjestu masovne grobnice u sjevernom Afganistanu, jedan viši službenik UN-a je ponovio da je organizacija posvećena pomaganju afganistanskim vlastima da sačuvaju takva mjesta da bi se zaštitili dokazi o zločinima koji su počinjeni u toku više od 35 godina rata. Glasnogovornik za UN Misiju u Afganistanu (eng.skr.UNAMA) izjavio je da će UN pružiti pomoć Afganistancima da otkriju prethodno počinjene zločine i da identifikuju žrtve.

Uz potporu UN-a i Ljekara za ljudska prava, osnovana je afganistanska Organizacija za forenzičke nauke (eng.skr. AFSO) u Kabulu u martu 2012. godine. AFSO je prva nevladina organizacija za forenzičke nauke u Afganistanu. Njena misija je dokumentovati i zaštititi integritet šest masovnih grobnica u tri različite provincije, kao i podizati svijest o važnosti dokumentovanja masovnih grobnica širom države.

Bonski sporazum koji je doveo do uspostave tranzicione vlasti u Afganistanu 2001.nije obuhvatio ratne zločine niti problem nestalih osoba, a snage S.A.D.-a i NATO-a su se inicijalno skoncentrisale na borbu protiv terorizma.

Afganistanska vlada kaže da će Državno pomirenje, Generalna amnestija i Zakon o stabilnosti iz 2010. povećati pomirenje i stabilnost. Kritičari, međutim, tvrde da zakon štiti imunitet onih koji su kršili ljudska prava i to često masovno. Međunarodni centar za tranzicionu pravdu:  (eng.skr.ICTJ), koji radi u Afganistanu od 2002. navodi: “Ovakve Amnestije promovišu nekažnjivost i smatraju se nezakonitim prema međunarodnom pravu.”