نشأ الصراع في السلفادور منذ عقد من التقلبات السياسية التي واجهت المؤسسة العسكرية خلالها السكان الزراعيين الذين لا يملكون أراضي. تعكس جريمة القتل التي ارتكبها رئيس الأساقفة اليميني أوسكار روميرو في مارس 1980 الوحشية التي ميزت العقد التالي

وقدرت التقديرات غير الرسمية عدد الذين فقدوا خلال الصراع الذي وقع في الفترة 1980-1992 بـ 8000 إلى 9000. كان هناك عدد كبير من هؤلاء أطفال ، يعتقد أن العديد منهم تم تبنيهم من خلال إجراءات غير منتظمة من قبل العائلات في السلفادور والولايات المتحدة وأوروبا

قانون العفو لعام 1993 ، الذي تمت الموافقة عليه بعد خمسة أيام فقط من إصدار لجنة الحقيقة المدعومة من الأمم المتحدة تقريرها (جزء لا يتجزأ من اتفاقية السلام) حول انتهاكات حقوق الإنسان بالجملة أثناء النزاع ، سمح لمرتكبي جرائم الاختفاء وغيرها من الجرائم بالفرار من العقاب

ومن ثم ، فإن جهود تحديد مكان المفقودين وتحديد هويتهم تمثل عنصرا هاما في عملية المصالحة الوطنية في مرحلة ما بعد الصراع ، حيث أن أسر المفقودين لا تملك في معظم الحالات خيار اللجوء إلى سبل الانتصاف القانونية

تم إنشاء العديد من المنظمات لمعالجة مشكلة المفقودين في السلفادور. وتشمل هذه المنظمات غير الحكومية “برو-بوكسيدا” ، التي تشكلت في عام 1994 للبحث عن الأطفال الذين اختفوا نتيجة للصراع

تم إشراك اللجنة الدولية لشؤون المفقودين في السلفادور بالشراكة مع مركز حقوق الإنسان التابع لجامعة كاليفورنيا في بيركلي ، من خلال منحة قدمتها الولايات المتحدة. يهدف مشروع اللجنة الدولية لشؤون المفقودين إلى تعزيز قدرة التحليل الجنائي للحمض النووي في البلاد ، وتعزيز بناء القدرات بشكل عام ، والتنسيق وتبادل المعلومات فيما يتعلق بتحديد مكان المفقودين وتحديد هويتهم

السلفادور

في أغسطس 2012 ، وقعت اللجنة الدولية لشؤون المفقودين اتفاقية مع مركز حقوق الإنسان و جريدة بوسكويدا بشأن توليد معلومات القرابة وبيانات الحمض النووي من العينات المرجعية البيولوجية الواردة من السلفادور